Seqreppy: uma biblioteca escrita em Python para representações numéricas de sequências genômicas

Abstract

A utilização das representações numéricas de sequências genômicas tem auxiliado pesquisadores na caracterização estrutural de genes desde o final do século XX, sendo frequentemente integradas com análises DSP e modelos de Machine Learning. Uma vez que essa integração não é uma tarefa trivial, o presente trabalho visou a construção de uma biblioteca que facilite a escolha e a utilização das representações numéricas comumente utilizadas.  Para isso, contou-se com linguagem Python na implementação da Seqreppy, seguindo o paradigma da orientação a objetos e incorporando 16 métodos de representação numérica. Espera-se, portanto, que a Seqreppy seja mais uma ferramenta usada no mapeamento e caracterização estrutural de genes.