Seqreppy: uma biblioteca escrita em Python para representações numéricas de sequências genômicas

Autores

  • Ednilson Alves Lomazi Centro Universitário da Fundação Educacional de Barretos
  • Willians Luiz Bueno de Souza Centro Universitário da Fundação Educacional de Barretos

Resumo

A utilização das representações numéricas de sequências genômicas tem auxiliado pesquisadores na caracterização estrutural de genes desde o final do século XX, sendo frequentemente integradas com análises DSP e modelos de Machine Learning. Uma vez que essa integração não é uma tarefa trivial, o presente trabalho visou a construção de uma biblioteca que facilite a escolha e a utilização das representações numéricas comumente utilizadas.  Para isso, contou-se com linguagem Python na implementação da Seqreppy, seguindo o paradigma da orientação a objetos e incorporando 16 métodos de representação numérica. Espera-se, portanto, que a Seqreppy seja mais uma ferramenta usada no mapeamento e caracterização estrutural de genes.

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Publicado

2021-08-20

Como Citar

Lomazi, E. A. ., & Souza, W. L. B. de . (2021). Seqreppy: uma biblioteca escrita em Python para representações numéricas de sequências genômicas. Revista De Sistemas De Informação, 1(01). Recuperado de https://revistaresi.com.br/index.php/resi/article/view/14